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programme 2éme année biologie lmd
ZOOLOGIE VHG : 75h Cours : 30h TP/TD : 45h Crédits: 8 Coef: 3 Semestre 3 EVOLUTION DU RÈGNE ANIMAL SOUS RÈGNE DES UNICELLULAIRES : PROTOZOAIRES Embranchement des rhizopodes Embranchement des flagellées (Sarcomastigophora) Embranchement des sporozoaires (Apicomplexa) Embranchement des ciliés Embranchement des cnidosporidies SOUS RÈGNE DES PLURICELLULAIRES : MÉTAZOAIRES Didermique Embranchement des spongiaires Embranchement des cnidaires Embranchement des cténaires Tridermique Embranchement des plathelmintes Embranchement des nemathelmintes Embranchement des annélides Embranchement des lophoriens Embranchement des némertes Embranchement des rotiferes Embranchement des mollusques Embranchement des arthropodes sous Embranchement des chélicérates classe des mérostomes classe des arachnides sous Embranchement des mandibulates classe des crustacés classe des insectes (présentation des différents ordres) classe des myriapodes Embranchement des échinodermes Embranchement des stomocordés – henncordes Embranchement des pogonophores Embranchement des tuniciers Embranchement des céphalocordés Embranchement des vertèbres sous Embranchement des gnathostomes classe des cyclostomes sous Embranchement des agnatostomes super-classe des poissons classe des chondrichtyens classe des osteichthyens super-classe des tétrapodes classe des batraciens classe des reptiles classe des oiseaux classe mammifères PROGRAMME DES TRAVAUX PRATIQUES : LES INVERTEBRES Etude morphologique d’un invertébré utilisation de la faune Etude d’une annélide polychète : nereldis Morphologie externe Métamérie Etude d’une annélide polychète : Métamérie Appareil circulatoire Appareil excréteur Etude d’une annélide oligochète : le lambris Morphologie externe Appareil génital hermaphrodites Système nerveux Etude d’une annélide achète : la sangoie Appareil génital hermaphrodites Système nerveux Etude d’un gastéropode Système nerveux etorse Etude d’un gastropode opistobranche : l’aplyste Morphologie externe Système nerveux de torsion) Etude d’un gastropode pulmoné : l’escargot Coquille Morphologie externe Injection appareil circulaire Appareil génital hermaphrodite Système nerveux (Céphalisation) Etude d’un mollusque céphalopode : la sèche ou le calamar Morphologie externe Appareil génital O et O Appareil excréteur Appareil circulatoire (injection) Système nerveux Etude d’un crustacé stomatopode : la squille Morphologie externe, étude détaillée des appendices Injection système circulaire Anatomie interne Etude d’un crustacé décapode : crevette penside ou grosse langoustine Morphologie externe Etude comparée des appendices avec ceux du stomatopode Etude d’un insecte : le papillon, la blatte ou le criquet Morphologie externe Pièces buccales Morphologie interne PROGRAMME DES TRAVAUX DIRIGES : LES VERTEBRES Les échinodermes : différentes classes, écologie, forme larvaire Films : les oursins Les danseuses de la mer Etoile de mer Les procordés : Tuniciers fixés, les tuniciers pélagiques céphalocordé Les poissons Principaux groupes Le cœlacanthe Migrations Adaptations écologiques Reproduction Les batraciens : Différents groupes, biologie et écologie Films : alytes obstétricaux Vie cachée des misseaux Les reptiles : différents groupes : biologie et écologie Venins et sérums Les crocodiles Les tortues marines Films : île au tortues Les reptiles Biologie de la vipère aspis Comportement prédateur de la vipère aspic Les oiseaux : différents groupes, migrations, reproduction Les mammifères : différents groupes, adaptation des membres (courses, vol et nage) Migration Les simiens (histoire) Les hominidés (histoire) Les mammifères en voie de disparition Anatomie comparée du squelette : céphalique, axial, zonal Système dentaire des vertébrés MICROBIOLOGIE VHG : 75h Cours : 45h TP/TD : 30h Crédits: 8 Coef: 3 Semestre 4 CHAPITRE I : LE MONDE MICROBIEN Historique Place de microorganismes dans le monde vivant Caractéristiques générales de la cellule procaryote CHAPITRE II Techniques d’observation de la cellule bactérienne La morphologie cellulaire La paroi Composition chimique Structure moléculaire Fonctions Coloration de Gram La membrane plasmique Composition chimique Structure Fonctions Le cytoplasme Les ribosomes Les substances de réserve Le chromosome Morphologie Composition Réplication chimique Structure Les plasmides Structure Réplication Propriétés Pilli Structure Fonction La capsule Morphologie Composition chimique Fonctions Les cils et flagelles Mise en évidence Structure Fonctions La spore Morphologie Structure Phénomènes de sporulation Propriétés Germination CHAPITRE III : CLASSIFICATION BACTÉRIENNE Classification phénétique Classification phylogénique Classification de Bergey CHAPITRE IV : NUTRITION BACTÉRIENNE Besoins élémentaires Facteurs de croissance Types trophiques Paramètres physico-chimiques (température, pH, O2 et aW) CHAPITRE V : CROISSANCE BACTÉRIENNE Mesure de la croissance Paramètres de la croissance Courbe de croissance (culture discontinue) Culture bactérienne Agents antimicrobiens CHAPITRE VI : NOTIONS DE MYCOLOGIE ET DE VIROLOGIE Mycologie (levure et moisissure) Taxonomie Morphologie Reproduction Virologie Morphologie (capside et enveloppe) Différents types de virus CHAPITRE VII : RÔLE DES MICROORGANISMES Microorganismes et environnement Microorganismes et santé Microorganismes et industrie Microorganismes et agriculture TRAVAUX PRATIQUES : Introduction au laboratoire de microbiologie ; Méthodes d’étude des micro-organismes et les différents procédés de stérilisation ; Méthodes d’ensemencement ; Etude microscopique des bactéries, coloration simple Etude morphologique des différentes colonies bactériennes sur milieu de culture ; Coloration de gram ; Les milieux de culture ; Etude de la croissance bactérienne ; Critères d’identification biochimique des bactéries ; Levures et cyanobactéries ; Les inhibiteurs de la croissance, l’antibiogramme ; Isolement de la flore totale et spécifique de certains produits (eau, lait…). ECOLOGIE GENERALE VHG : 60h Cours : 30h TP/TD : 30h Crédits: 6 Coef: 3 Semestre 4 CHAPITRE I: Définition de l’écosystème et des constituants (Notions de biocénose et facteur écologique.) Domaines d’intervention CHAPITRE II: LES FACTEURS DU MILIEU Facteurs abiotiques Climatiques Edaphique Hydrique Facteurs biotiques Compétitions Ravageurs et Prédateurs Interaction de coopération et de symbiose Parasitisme Interaction des milieux et des êtres vivants Rôle des facteurs écologiques dans la régulation des populations: notion d’optimum écologique, valence écologique Niche écologique. CHAPITRE III : STRUCTURE DES ÉCOSYSTÈMES : Structure des chaînes alimentaires ; relations entre les producteurs (autotrophes) et leur dépendance des nutriments et de l’énergie lumineuse ou chimique. Les consommateurs (Hélérotrophes ) qui sont liés aux producteurs et enfin les décomposeurs qui assurent le recyclage et la minéralisation de la matière organique. CHAPITRE IV : FONCTIONNEMENT DES ÉCOSYSTÈMES Flux d’énergie au niveau de la biosphère : Notions de pyramides écologiques, de production, de productivité et de rendement bioénergétiques Circulation de la matière dans les écosystèmes et principaux cycles bio géochimiques Influence des activités humaines sur les équilibres biologiques et particulièrement sur la perturbation des cycles bio géochimiques ( conséquences de la pollution des milieux aquatiques et de la pollution atmosphérique (eutrophisation ,effet de serre , ozone, pluies acides.) CHAPITRE V : DESCRIPTION SOMMAIRE DES PRINCIPAUX ECOSYSTEMES Foret, prairie, eaux de surface, océan Evolution des écosystèmes et notion de climax Travaux pratiques : sortie sur terrain de 8 heures chacune sur deux écosystèmes au choix. Travaux dirigés : 10 heures concernent les méthodes des études du milieu. BIOCHIMIE VHG : 75h Cours : 45h TP/TD : 30h Crédits: 8 Coef: 3 Semestre 3 LIAISONS CHIMIQUES Liaisons fortes Liaisons faibles STRUCTURE ET PROPRIÉTÉS PHYSICO-CHIMIQUES DES GLUCIDES Oses simples Oligosides Polyholosides, hétérosides. STRUCTURE ET PROPRIÉTÉS PHYSICO-CHIMIQUES DES LIPIDES lipides simples lipides complexes STRU. ET PPTÉS PHY-CHIM DES ACIDES AMINÉS, PEPTIDES ET PROTÉINES les acides aminés, les peptides, les protéines structure (primaire et secondaire, tertiaire et quaternaire) Propriétés et effet des traitements (solubilité, comportement électrophorétique, dénaturation.) séparation des protéines NOTIONS D’ENZYMOLOGIE définition, classification mécanismes d’action site actif cinétique enzymatique et types de représentation inhibition enzymatique phénomène d’allostérie NOTIONS DE BIOÉNERGÉTIQUE types de réaction chimique la chaîne respiratoire et la production d’énergie phosphorylation et réaction d’oxydoréduction MÉTABOLISME DES GLUCIDES catabolisme (glycolyse, glycogénolyse, voie des pentoses phosphate, cycle de Krebs, bilan énergétique) anabolisme (néoglucogenèse et glycogénogenèse) régulation MÉTABOLISME DES LIPIDES catabolisme des acides gras (Béta-oxydation ) catabolisme des stérols biosynthèses des acides gras et des triglycérides biosynthèse des stérols régulation MÉTABOLISME DES PEPTIDES ET DES PROTÉINES catabolisme des groupements aminés catabolisme des groupements carboxyliques catabolisme de la chaîne latérale les acides glucoformateurs et cétogènes biosynthèse des acides aminés indispensables élimination de l’azote, cycle de l’urée exemple de biosynthèse de peptides (cas de peptides à activité biologique) exemple de biosynthèse de protéines régulation STRUC. ET MÉTABOLISME D’AUTRES COMPOSÉS D’INTÉRÊT BIOLOGIQUE vitamines hormones TRAVAUX PRATIQUES : détermination du pouvoir rotatoire des sucres dosage du glucose, fructose ou lactose détermination de l’indice d’iode et de saponification des lipides séparation des acides aminés en CCM séparation électrophorétique des protéines mise en évidence et mesure de l’activité enzymatique dosage de la vitamine C GENETIQUE VHG : 75h Cours : 45h TP/TD : 30h Crédits: 8 Coef: 3 Semestre 3 MATÉRIEL GÉNÉTIQUE Nature chimique du matériel génétique Structure des acides nucléiques ( ADN-ARN) Réplication de l’ADN : chez les Procaryotes et les Eucaryotes Organisation en chromosomes TRANSMISSION DES CARACTERES GENETIQUES CHEZ LES EUCARYOTES GÉNÉTIQUE DES HAPLOIDES les gènes indépendants Gènes liés Etablissement des cartes génétiques GENETIQUE DES DIPLOIDES les gènes indépendants Gènes liés Etablissement des cartes génétiques GENETIQUE BACTERIENNE ET VIRALE Conjugaison Transformation Transduction Infection mixte chez les virus SYNTHESE PROTEIQUE transcription code génétique traduction MUTATIONS GENETIQUES MUTATIONS CHROMOSOMIQUES variation structurale variation numérique (exemple humain) STRUCTURE ET FONCTION DU GENE : GENETIQUE BIOCHIMIQUE REGULATION DE L’EXPRESSION GENETIQUE opéron lactose chez les procaryotes exemple chez les eucaryotes NOTIONS DE GENETIQUE EXTRA-CHROMOSOMIQUE NOTION DE GENETIQUE DES POPULATIONS PROPOSITIONS DE TRAVAUX DIRIGES. Matériel génétique Transmission des caractères Mono et di hybridisme (Cas particuliers) Gènes liés Cartes génétiques Synthèse des protéines (Code génétique) Structure fine du gène (recombinaison intragénique) Conjugaison et carte factorielle Génétique des populations PROPOSITIONS DE TRAVAUX DIRIGES. Extraction de l’ADN Dosage de l’ADN Corpuscule de BARR IMMUNOLOGIE VHG : 45h Cours : 30h TP/TD : 15h Crédits: 4 Coef: 2 Semestre 4 INTRODUCTION A L’IMMUNOLOGIE. Rôle de l’immunité Rapport avec le quotidien et grandes découvertes ONTOGENESE DU SYSTEME IMMUNITAIRE Cellules B et organes lymphoïdes Cellules T Education des cellules B à l’intérieur de la moelle Education des cellules T à l’intérieur du thymus Autres cellules (Cellules myéloïdes) CMH LA REPONSE IMMUNITAIRE NON SPECIFIQUE Cellules intervenantes et complément LA REPONSE IMMUNITAIRE SPECIFIQUE cellulaire humorale COOPERATION CELLULAIRE ET HUMORALE Coopération entre les différentes cellules Cytokines DYSFONCTIONNEMENT DU SYSTEME IMMUNITAIRE LES PRINCIPAUX TESTS EN IMMUNOLOGIE Agglutination Immuno-précipitation Immunoélectrophorèse Immunofluorescence ElisaTechniques TRAVAUX PRATIQUES Réaction Ag-Ac( précipitation : immunodiffusion, ELISA, RIA….) Préparation de lymphocytes de monocytes à partir de sang total Séparation de lymphocytes T et B Test de lymphomicrocytotoxicité BIOPHYSIQUE VHG : 45h Cours : 30h TP/TD : 15h Crédits: 3 Coef: 2 Semestre 3 GÉNÉRALITÉS SUR LES SOLUTIONS ÉLECTROLYTIQUES Définition et propriétés des solutions électrolytiques Conductivité, résistivité, et résistance de la solution électrolytique PHÉNOMÈNE DE DIFFUSION Diffusion en phase aqueuse Diffusion à travers les membranes artificielles et biologiques (phénomène d’osmose en particulier) CHAPITRE III : ETUDE DES INTERFACES SOLIDE-LIQUIDE Théorie de la double couche électrochimique Echanges ionique interface solide-liquide Applications biologiques ETUDE DES INTERFACES LIQUIDE-GAZ (PHÉNOMÈNE DE SURFACES) Mise en évidence de l’interface solide-gaz (tension superficielle) Mesures et applications biologiques HÉMODYNAMIQUE Etude de la viscosité (définition, mesures et applications biologiques) Mécanique des fluides TRAVAUX PRATIQUES Initiation : Préparation de solutions neutres et ioniques calcul de concentration Compartiments liquidiens : préparation de sérum et de plasma sanguin Détermination de volume sanguin par injection de bleu Evans Osmose, Pression osmotique et cryscopie Mise en évidence avec une membrane hémiperméable avec solution glucosée ou de Nacl et calcul de la PO résultante à l’aide de la pression hydrostatique Mise en évidence du potentiel hydrique d’une graine et de la pression de succion de la sève (solution glucosée par une plante Pression oncotique avec une solution d’albumine et une membrane dialysante La diffusion Expérimentation sur diffusion de substance colorée neutre ionique Calcul de quantité diffusée et état d’équilibre Sédimentation et centrifugation Sédimentation des hématies (effet boycott) et calcul de la vitesse de sédimentation Centrifugation d’une solution biologique et fractionnement cellulaire Phénomènes de tension superficielle Phénomènes de capillarité avec eau, huile, solution dans un tube et angle de raccordement Contact huile –eau et calcul de l’énergie de cohésion et d’adhésion Viscosité Technique de mesure de la viscosité (immersion, la bille) Hémodynamique TRAVAUX DIRIGES L’écoulement sanguin. Travail cardiaque. MATHEMATIQUE ET STATISTIQUES 2 VHG : 45h Cours : 30h TP/TD : 15h Crédits: 4 Coef: 2 Semestre 4 CHAPITRE 1 MATHEMATIQUES Matrices, déterminants, valeurs propres. Application à la résolution des équations différentielles. CHAPITRE 2 STATISTIQUES DESCRIPTIVE Série statistiques. Distribution des fréquences. Représentations graphiques. Paramètre caractéristique. TERMINOLOGIE2 VHG : 15h Cours : 15h TP/TD : 0h Crédits: 1.5 Coef: 1 Semestre 2 LANGUES
METHODE DE TRAVAIL VHG : 15h Cours : 15h TP/TD : 0h Crédits: 1.5 Coef: 1 Semestre 2 METHODE DE TRAVAIL
BOTANIQUE VHG : 75h Cours : 45h TP/TD : 30h Crédits: 8 Coef: 3 Semestre 4 PREMIERE PARTIE Introduction générale à la botanique Définition, notion et concept en classification et systématique de grands groupes du règne végétal et critères de classification. LES ALGUES Morphologie t évolution des talles Caractères cytologiques (paroi, structure et évolution des plastes) Reproduction : notion de gamie, cycle de développement (mono, di, tri génique) Systématique de particularité des principaux groupes Les algues procaryotes : Cyanoschisophytes – cyanobactérie) Les algues eucaryotes : phycophytes Les rhodophycophytes Les chromophycophytes (pyrro-chryse-algeno-pheo) Les chlorophycophytes Les charophycophytes LES CHAMPIGNONS & LICHENS Problèmes posés par la classification des champignons Structure des talles (mycéliums, siroma, sclérote,…) Reproduction asexuée (arhospors, chlamydospores, conidies) et sexuée (types de plasmogamies,) Myxomycètes Phycomycètes Trichomycètes Basidomycètes Zygomycètes Une association particulière algue-champignon : les lichens Structure, reproduction classification LES BRYOPHYTES (Etude comparée de morphologie et reproduction dans les différentes classes) Mousses (structure de la capsule dans différents ordres) Hépatiques (évolution régression des marchantiales) Anthocéroles LES PTERIDOPHYTES Généralité sur les caractères morphologiques particuliers des ptéridophytes Importance évolutive de la reproduction : notion d’endoprotallie hétérosporie et réduction de la phase gamétophyliques Systématique Psilophytinées Lycopodinées Aquisetinées Filininées Nb. : Prévoir un TP pour chaque groupe. DEUXIEME PARTIE LES PHANEROGAMES Importance des préphanérogames du point de vue évolutif Reproduction (notion d’ovule) Systématique : Ptéridospermes (caytoniales, cycadales) Cordaites (cordaitales, gunkgoales) Les gymnospermes Caractères morphologiques, anatomiques et chimiotaxonomiques Reproduction (notion de fleur, d’inflorescence et de grains) Systématique pinales, araucariales, podocarpales, eupressales, taxales Un groupe charnière : les chlamydospermes Ephedrales, welwitshiales, gntales Les Angiospermes Caractères morphologiques, anatomiques et chimiotaxonomiques Reproduction systématique NB. : Prévoir 06 TP |
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