programme 2éme année biologie lmd
12-09-2010, 05:38 PM

ZOOLOGIE


VHG : 75h
Cours : 30h
TP/TD : 45h
Crédits: 8
Coef: 3

Semestre 3






EVOLUTION DU RÈGNE ANIMAL

SOUS RÈGNE DES UNICELLULAIRES : PROTOZOAIRES
Embranchement des rhizopodes
Embranchement des flagellées (Sarcomastigophora)
Embranchement des sporozoaires (Apicomplexa)
Embranchement des ciliés
Embranchement des cnidosporidies

SOUS RÈGNE DES PLURICELLULAIRES : MÉTAZOAIRES
Didermique
Embranchement des spongiaires
Embranchement des cnidaires
Embranchement des cténaires
Tridermique
Embranchement des plathelmintes
Embranchement des nemathelmintes
Embranchement des annélides
Embranchement des lophoriens
Embranchement des némertes
Embranchement des rotiferes
Embranchement des mollusques
Embranchement des arthropodes
sous Embranchement des chélicérates
classe des mérostomes
classe des arachnides
sous Embranchement des mandibulates
classe des crustacés
classe des insectes (présentation des différents ordres)
classe des myriapodes
Embranchement des échinodermes
Embranchement des stomocordés – henncordes
Embranchement des pogonophores
Embranchement des tuniciers
Embranchement des céphalocordés
Embranchement des vertèbres
sous Embranchement des gnathostomes
classe des cyclostomes
sous Embranchement des agnatostomes
super-classe des poissons
classe des chondrichtyens
classe des osteichthyens
super-classe des tétrapodes
classe des batraciens
classe des reptiles
classe des oiseaux
classe mammifères

PROGRAMME DES TRAVAUX PRATIQUES : LES INVERTEBRES

Etude morphologique d’un invertébré utilisation de la faune
Etude d’une annélide polychète : nereldis
Morphologie externe
Métamérie
Etude d’une annélide polychète :
Métamérie
Appareil circulatoire
Appareil excréteur
Etude d’une annélide oligochète : le lambris
Morphologie externe
Appareil génital hermaphrodites
Système nerveux
Etude d’une annélide achète : la sangoie
Appareil génital hermaphrodites
Système nerveux
Etude d’un gastéropode
Système nerveux etorse
Etude d’un gastropode opistobranche : l’aplyste
Morphologie externe
Système nerveux de torsion)
Etude d’un gastropode pulmoné : l’escargot
Coquille
Morphologie externe
Injection appareil circulaire
Appareil génital hermaphrodite
Système nerveux (Céphalisation)
Etude d’un mollusque céphalopode : la sèche ou le calamar
Morphologie externe
Appareil génital O et O
Appareil excréteur
Appareil circulatoire (injection)
Système nerveux
Etude d’un crustacé stomatopode : la squille
Morphologie externe, étude détaillée des appendices
Injection système circulaire
Anatomie interne
Etude d’un crustacé décapode : crevette penside ou grosse langoustine
Morphologie externe
Etude comparée des appendices avec ceux du stomatopode
Etude d’un insecte : le papillon, la blatte ou le criquet
Morphologie externe
Pièces buccales
Morphologie interne

PROGRAMME DES TRAVAUX DIRIGES : LES VERTEBRES

Les échinodermes : différentes classes, écologie, forme larvaire
Films : les oursins
Les danseuses de la mer
Etoile de mer
Les procordés : Tuniciers fixés, les tuniciers pélagiques céphalocordé
Les poissons
Principaux groupes
Le cœlacanthe
Migrations
Adaptations écologiques
Reproduction
Les batraciens : Différents groupes, biologie et écologie
Films : alytes obstétricaux
Vie cachée des misseaux
Les reptiles : différents groupes : biologie et écologie
Venins et sérums
Les crocodiles
Les tortues marines
Films : île au tortues
Les reptiles
Biologie de la vipère aspis
Comportement prédateur de la vipère aspic
Les oiseaux : différents groupes, migrations, reproduction
Les mammifères : différents groupes, adaptation des membres (courses, vol et nage)
Migration
Les simiens (histoire)
Les hominidés (histoire)
Les mammifères en voie de disparition
Anatomie comparée du squelette : céphalique, axial, zonal
Système dentaire des vertébrés

MICROBIOLOGIE


VHG : 75h
Cours : 45h
TP/TD : 30h
Crédits: 8
Coef: 3

Semestre 4






CHAPITRE I : LE MONDE MICROBIEN
Historique
Place de microorganismes dans le monde vivant
Caractéristiques générales de la cellule procaryote
CHAPITRE II


Techniques d’observation de la cellule bactérienne
La morphologie cellulaire
La paroi
Composition chimique
Structure moléculaire
Fonctions
Coloration de Gram
La membrane plasmique
Composition chimique
Structure
Fonctions
Le cytoplasme
Les ribosomes
Les substances de réserve
Le chromosome
Morphologie
Composition
Réplication chimique
Structure

Les plasmides
Structure
Réplication
Propriétés
Pilli
Structure
Fonction
La capsule
Morphologie
Composition chimique
Fonctions
Les cils et flagelles
Mise en évidence
Structure
Fonctions
La spore
Morphologie
Structure
Phénomènes de sporulation
Propriétés
Germination



CHAPITRE III : CLASSIFICATION BACTÉRIENNE
Classification phénétique
Classification phylogénique
Classification de Bergey

CHAPITRE IV : NUTRITION BACTÉRIENNE
Besoins élémentaires
Facteurs de croissance
Types trophiques
Paramètres physico-chimiques (température, pH, O2 et aW)

CHAPITRE V : CROISSANCE BACTÉRIENNE
Mesure de la croissance
Paramètres de la croissance
Courbe de croissance (culture discontinue)
Culture bactérienne
Agents antimicrobiens

CHAPITRE VI : NOTIONS DE MYCOLOGIE ET DE VIROLOGIE
Mycologie (levure et moisissure)
Taxonomie
Morphologie
Reproduction
Virologie
Morphologie (capside et enveloppe)
Différents types de virus

CHAPITRE VII : RÔLE DES MICROORGANISMES
Microorganismes et environnement
Microorganismes et santé
Microorganismes et industrie
Microorganismes et agriculture

TRAVAUX PRATIQUES :
Introduction au laboratoire de microbiologie ;
Méthodes d’étude des micro-organismes et les différents procédés de stérilisation ;
Méthodes d’ensemencement ;
Etude microscopique des bactéries, coloration simple
Etude morphologique des différentes colonies bactériennes sur milieu de culture ;
Coloration de gram ;
Les milieux de culture ;
Etude de la croissance bactérienne ;
Critères d’identification biochimique des bactéries ;
Levures et cyanobactéries ;
Les inhibiteurs de la croissance, l’antibiogramme ;
Isolement de la flore totale et spécifique de certains produits (eau, lait…).


ECOLOGIE GENERALE


VHG : 60h
Cours : 30h
TP/TD : 30h
Crédits: 6
Coef: 3

Semestre 4






CHAPITRE I:
Définition de l’écosystème et des constituants (Notions de biocénose et facteur écologique.)
Domaines d’intervention

CHAPITRE II: LES FACTEURS DU MILIEU
Facteurs abiotiques
Climatiques
Edaphique
Hydrique
Facteurs biotiques
Compétitions
Ravageurs et Prédateurs
Interaction de coopération et de symbiose
Parasitisme
Interaction des milieux et des êtres vivants
Rôle des facteurs écologiques dans la régulation des populations:
notion d’optimum écologique,
valence écologique
Niche écologique.

CHAPITRE III : STRUCTURE DES ÉCOSYSTÈMES :
Structure des chaînes alimentaires ; relations entre les producteurs (autotrophes) et leur dépendance des nutriments et de l’énergie lumineuse ou chimique.
Les consommateurs (Hélérotrophes ) qui sont liés aux producteurs et enfin les décomposeurs qui assurent le recyclage et la minéralisation de la matière organique.

CHAPITRE IV : FONCTIONNEMENT DES ÉCOSYSTÈMES
Flux d’énergie au niveau de la biosphère :
Notions de pyramides écologiques, de production, de productivité et de rendement bioénergétiques
Circulation de la matière dans les écosystèmes et principaux cycles bio géochimiques
Influence des activités humaines sur les équilibres biologiques et particulièrement sur la perturbation des cycles bio géochimiques ( conséquences de la pollution des milieux aquatiques et de la pollution atmosphérique (eutrophisation ,effet de serre , ozone, pluies acides.)

CHAPITRE V : DESCRIPTION SOMMAIRE DES PRINCIPAUX ECOSYSTEMES
Foret, prairie, eaux de surface, océan
Evolution des écosystèmes et notion de climax

Travaux pratiques : sortie sur terrain de 8 heures chacune sur deux écosystèmes au choix.
Travaux dirigés : 10 heures concernent les méthodes des études du milieu.


BIOCHIMIE


VHG : 75h
Cours : 45h
TP/TD : 30h
Crédits: 8
Coef: 3

Semestre 3






LIAISONS CHIMIQUES
Liaisons fortes
Liaisons faibles

STRUCTURE ET PROPRIÉTÉS PHYSICO-CHIMIQUES DES GLUCIDES
Oses simples
Oligosides
Polyholosides, hétérosides.

STRUCTURE ET PROPRIÉTÉS PHYSICO-CHIMIQUES DES LIPIDES
lipides simples
lipides complexes

STRU. ET PPTÉS PHY-CHIM DES ACIDES AMINÉS, PEPTIDES ET PROTÉINES
les acides aminés, les peptides, les protéines
structure (primaire et secondaire, tertiaire et quaternaire)
Propriétés et effet des traitements (solubilité, comportement électrophorétique, dénaturation.)
séparation des protéines

NOTIONS D’ENZYMOLOGIE
définition, classification
mécanismes d’action
site actif
cinétique enzymatique et types de représentation
inhibition enzymatique
phénomène d’allostérie

NOTIONS DE BIOÉNERGÉTIQUE
types de réaction chimique
la chaîne respiratoire et la production d’énergie
phosphorylation et réaction d’oxydoréduction

MÉTABOLISME DES GLUCIDES
catabolisme (glycolyse, glycogénolyse, voie des pentoses phosphate, cycle de Krebs, bilan énergétique)
anabolisme (néoglucogenèse et glycogénogenèse)
régulation

MÉTABOLISME DES LIPIDES
catabolisme des acides gras (Béta-oxydation )
catabolisme des stérols
biosynthèses des acides gras et des triglycérides
biosynthèse des stérols
régulation

MÉTABOLISME DES PEPTIDES ET DES PROTÉINES
catabolisme des groupements aminés
catabolisme des groupements carboxyliques
catabolisme de la chaîne latérale
les acides glucoformateurs et cétogènes
biosynthèse des acides aminés indispensables
élimination de l’azote, cycle de l’urée
exemple de biosynthèse de peptides (cas de peptides à activité biologique)
exemple de biosynthèse de protéines
régulation

STRUC. ET MÉTABOLISME D’AUTRES COMPOSÉS D’INTÉRÊT BIOLOGIQUE
vitamines
hormones

TRAVAUX PRATIQUES :
détermination du pouvoir rotatoire des sucres
dosage du glucose, fructose ou lactose
détermination de l’indice d’iode et de saponification des lipides
séparation des acides aminés en CCM
séparation électrophorétique des protéines
mise en évidence et mesure de l’activité enzymatique
dosage de la vitamine C


GENETIQUE


VHG : 75h
Cours : 45h
TP/TD : 30h
Crédits: 8
Coef: 3

Semestre 3






MATÉRIEL GÉNÉTIQUE
Nature chimique du matériel génétique
Structure des acides nucléiques ( ADN-ARN)
Réplication de l’ADN : chez les Procaryotes et les Eucaryotes
Organisation en chromosomes

TRANSMISSION DES CARACTERES GENETIQUES CHEZ LES EUCARYOTES

GÉNÉTIQUE DES HAPLOIDES
les gènes indépendants
Gènes liés
Etablissement des cartes génétiques

GENETIQUE DES DIPLOIDES
les gènes indépendants
Gènes liés
Etablissement des cartes génétiques

GENETIQUE BACTERIENNE ET VIRALE
Conjugaison
Transformation
Transduction
Infection mixte chez les virus

SYNTHESE PROTEIQUE
transcription
code génétique
traduction

MUTATIONS GENETIQUES

MUTATIONS CHROMOSOMIQUES
variation structurale
variation numérique (exemple humain)

STRUCTURE ET FONCTION DU GENE : GENETIQUE BIOCHIMIQUE

REGULATION DE L’EXPRESSION GENETIQUE
opéron lactose chez les procaryotes
exemple chez les eucaryotes

NOTIONS DE GENETIQUE EXTRA-CHROMOSOMIQUE

NOTION DE GENETIQUE DES POPULATIONS

PROPOSITIONS DE TRAVAUX DIRIGES.
Matériel génétique
Transmission des caractères
Mono et di hybridisme (Cas particuliers)
Gènes liés
Cartes génétiques
Synthèse des protéines (Code génétique)
Structure fine du gène (recombinaison intragénique)
Conjugaison et carte factorielle
Génétique des populations

PROPOSITIONS DE TRAVAUX DIRIGES.
Extraction de l’ADN
Dosage de l’ADN
Corpuscule de BARR


IMMUNOLOGIE


VHG : 45h
Cours : 30h
TP/TD : 15h
Crédits: 4
Coef: 2

Semestre 4






INTRODUCTION A L’IMMUNOLOGIE.
Rôle de l’immunité
Rapport avec le quotidien et grandes découvertes

ONTOGENESE DU SYSTEME IMMUNITAIRE
Cellules B et organes lymphoïdes
Cellules T
Education des cellules B à l’intérieur de la moelle
Education des cellules T à l’intérieur du thymus
Autres cellules (Cellules myéloïdes)

CMH

LA REPONSE IMMUNITAIRE NON SPECIFIQUE
Cellules intervenantes et complément
LA REPONSE IMMUNITAIRE SPECIFIQUE
cellulaire
humorale
COOPERATION CELLULAIRE ET HUMORALE
Coopération entre les différentes cellules
Cytokines

DYSFONCTIONNEMENT DU SYSTEME IMMUNITAIRE

LES PRINCIPAUX TESTS EN IMMUNOLOGIE
Agglutination
Immuno-précipitation
Immunoélectrophorèse
Immunofluorescence
ElisaTechniques

TRAVAUX PRATIQUES
Réaction Ag-Ac( précipitation : immunodiffusion, ELISA, RIA….)
Préparation de lymphocytes de monocytes à partir de sang total
Séparation de lymphocytes T et B
Test de lymphomicrocytotoxicité


BIOPHYSIQUE


VHG : 45h
Cours : 30h
TP/TD : 15h
Crédits: 3
Coef: 2

Semestre 3






GÉNÉRALITÉS SUR LES SOLUTIONS ÉLECTROLYTIQUES
Définition et propriétés des solutions électrolytiques
Conductivité, résistivité, et résistance de la solution électrolytique

PHÉNOMÈNE DE DIFFUSION
Diffusion en phase aqueuse
Diffusion à travers les membranes artificielles et biologiques (phénomène d’osmose en particulier)

CHAPITRE III : ETUDE DES INTERFACES SOLIDE-LIQUIDE
Théorie de la double couche électrochimique
Echanges ionique interface solide-liquide
Applications biologiques

ETUDE DES INTERFACES LIQUIDE-GAZ (PHÉNOMÈNE DE SURFACES)
Mise en évidence de l’interface solide-gaz (tension superficielle)
Mesures et applications biologiques

HÉMODYNAMIQUE
Etude de la viscosité (définition, mesures et applications biologiques)
Mécanique des fluides

TRAVAUX PRATIQUES
Initiation : Préparation de solutions neutres et ioniques calcul de concentration
Compartiments liquidiens :
préparation de sérum et de plasma sanguin
Détermination de volume sanguin par injection de bleu Evans
Osmose, Pression osmotique et cryscopie
Mise en évidence avec une membrane hémiperméable avec solution glucosée ou de Nacl et calcul de la PO résultante à l’aide de la pression hydrostatique
Mise en évidence du potentiel hydrique d’une graine et de la pression de succion de la sève (solution glucosée par une plante
Pression oncotique avec une solution d’albumine et une membrane dialysante
La diffusion
Expérimentation sur diffusion de substance colorée neutre ionique
Calcul de quantité diffusée et état d’équilibre
Sédimentation et centrifugation
Sédimentation des hématies (effet boycott) et calcul de la vitesse de sédimentation
Centrifugation d’une solution biologique et fractionnement cellulaire
Phénomènes de tension superficielle
Phénomènes de capillarité avec eau, huile, solution dans un tube et angle de raccordement
Contact huile –eau et calcul de l’énergie de cohésion et d’adhésion
Viscosité
Technique de mesure de la viscosité (immersion, la bille)
Hémodynamique

TRAVAUX DIRIGES
L’écoulement sanguin.
Travail cardiaque.
MATHEMATIQUE ET STATISTIQUES 2


VHG : 45h
Cours : 30h
TP/TD : 15h
Crédits: 4
Coef: 2

Semestre 4






CHAPITRE 1 MATHEMATIQUES
Matrices, déterminants, valeurs propres.
Application à la résolution des équations différentielles.

CHAPITRE 2 STATISTIQUES DESCRIPTIVE
Série statistiques.
Distribution des fréquences.
Représentations graphiques.
Paramètre caractéristique.


TERMINOLOGIE2


VHG : 15h
Cours : 15h
TP/TD : 0h
Crédits: 1.5
Coef: 1

Semestre 2






LANGUES
  • Français fonctionnel
  • Anglais


METHODE DE TRAVAIL


VHG : 15h
Cours : 15h
TP/TD : 0h
Crédits: 1.5
Coef: 1

Semestre 2






METHODE DE TRAVAIL
  • Initiation à la recherche bibliographique
  • Rédaction d’un rapport scientifique
  • Initiation à la lecture et à la compréhension d’un article scientifique
BOTANIQUE


VHG : 75h
Cours : 45h
TP/TD : 30h
Crédits: 8
Coef: 3

Semestre 4






PREMIERE PARTIE

Introduction générale à la botanique
Définition, notion et concept en classification et systématique de grands groupes du règne végétal et critères de classification.

LES ALGUES
Morphologie t évolution des talles
Caractères cytologiques (paroi, structure et évolution des plastes)
Reproduction : notion de gamie, cycle de développement (mono, di, tri génique)
Systématique de particularité des principaux groupes
Les algues procaryotes : Cyanoschisophytes – cyanobactérie)
Les algues eucaryotes : phycophytes
Les rhodophycophytes
Les chromophycophytes (pyrro-chryse-algeno-pheo)
Les chlorophycophytes
Les charophycophytes

LES CHAMPIGNONS & LICHENS
Problèmes posés par la classification des champignons
Structure des talles (mycéliums, siroma, sclérote,…)
Reproduction asexuée (arhospors, chlamydospores, conidies) et sexuée (types de plasmogamies,)
Myxomycètes
Phycomycètes
Trichomycètes
Basidomycètes
Zygomycètes
Une association particulière algue-champignon : les lichens
Structure,
reproduction
classification

LES BRYOPHYTES
(Etude comparée de morphologie et reproduction dans les différentes classes)
Mousses (structure de la capsule dans différents ordres)
Hépatiques (évolution régression des marchantiales)
Anthocéroles

LES PTERIDOPHYTES
Généralité sur les caractères morphologiques particuliers des ptéridophytes
Importance évolutive de la reproduction : notion d’endoprotallie hétérosporie et réduction de la phase gamétophyliques
Systématique
Psilophytinées
Lycopodinées
Aquisetinées
Filininées

Nb. : Prévoir un TP pour chaque groupe.


DEUXIEME PARTIE

LES PHANEROGAMES
Importance des préphanérogames du point de vue évolutif
Reproduction (notion d’ovule)
Systématique :
Ptéridospermes (caytoniales, cycadales)
Cordaites (cordaitales, gunkgoales)
Les gymnospermes
Caractères morphologiques, anatomiques et chimiotaxonomiques
Reproduction (notion de fleur, d’inflorescence et de grains)
Systématique
pinales, araucariales, podocarpales, eupressales, taxales
Un groupe charnière : les chlamydospermes
Ephedrales, welwitshiales, gntales
Les Angiospermes
Caractères morphologiques, anatomiques et chimiotaxonomiques
Reproduction
systématique

NB. : Prévoir 06 TP